Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT3O75175 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT3O75175 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT3O75175 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT3O75175 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT3O75175 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT3O75175 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT3O75175 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNOT3O75175 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms