Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIA3O75145 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA3O75145 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA3O75145 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms