Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG13O75143 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG13O75143 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG13O75143 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG13O75143 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG13O75143 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG13O75143 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG13O75143 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG13O75143 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG13O75143 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG13O75143 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG13O75143 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG13O75143 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms