Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX2O60749 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX2O60749 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX2O60749 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX2O60749 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX2O60749 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX2O60749 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX2O60749 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX2O60749 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX2O60749 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms