Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL41O60662 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL41O60662 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms