Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DENRO43583 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DENRO43583 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DENRO43583 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DENRO43583 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DENRO43583 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DENRO43583 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DENRO43583 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DENRO43583 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DENRO43583 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms