Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ2O43526 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNQ2O43526 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ2O43526 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms