Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNB1O43157 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms