Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms