Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1CO15160 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1CO15160 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1CO15160 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1CO15160 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1CO15160 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1CO15160 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1CO15160 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1CO15160 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms