Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARPC1BO15143 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms