Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOCS3O14543 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOCS3O14543 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms