Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2F3O00716 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2F3O00716 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F3O00716 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F3O00716 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F3O00716 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F3O00716 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F3O00716 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F3O00716 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F3O00716 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F3O00716 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F3O00716 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F3O00716 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F3O00716 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms