Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIBO00712 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIBO00712 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIBO00712 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIBO00712 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIBO00712 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIBO00712 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIBO00712 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIBO00712 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIBO00712 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIBO00712 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIBO00712 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIBO00712 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIBO00712 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIBO00712 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIBO00712 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIBO00712 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIBO00712 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIBO00712 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIBO00712 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIBO00712 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIBO00712 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIBO00712 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms