Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA3O00505 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms