Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS1O00470 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS1O00470 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS1O00470 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms