Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE2AO00408 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms