Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN2O00339 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN2O00339 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN2O00339 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN2O00339 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN2O00339 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN2O00339 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN2O00339 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN2O00339 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN2O00339 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN2O00339 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN2O00339 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN2O00339 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN2O00339 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN2O00339 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms