Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CDO00329 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms