Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms