Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H7C1C5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H7C1C5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H7C1C5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H7C1C5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H7C1C5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H7C1C5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H7C1C5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
H7C1C5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H7C1C5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
H7C1C5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms