Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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