Protein–RNA interactions for Protein: H3BPM6

MKRN2OS, MKRN2 opposite strand protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2OSH3BPM6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MKRN2OSH3BPM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN2OSH3BPM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms