Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms