Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRDCB7Z8K6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms