Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VGLL3A8MV65 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VGLL3A8MV65 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VGLL3A8MV65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms