Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYSRT1A8MQ03 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms