Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF839A8K0R7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF839A8K0R7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.1 ms