Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA6L4A6NEF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms