Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6BA6NDN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6BA6NDN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms