Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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