Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms