Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms