Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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