Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms