Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 HLA-DQB1-203ENST00000399082 1219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AL590068.2-201ENST00000426067 378 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCA4P51532 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms