Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMAN1P49257 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms