Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD8P13378 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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