Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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