Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms