Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms