Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms