Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GCAP28676 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GCAP28676 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCAP28676 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms