Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms