Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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RNF182Q8N6D2 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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