Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC3P51654 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC3P51654 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC3P51654 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC3P51654 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC3P51654 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GPC3P51654 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GPC3P51654 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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