Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TPM2P07951 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TPM2P07951 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms