Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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