Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRACR2AQ9BSW2 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRACR2AQ9BSW2 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms