Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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